Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETDB1Q15047 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETDB1Q15047 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETDB1Q15047 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms