Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NCAPD2Q15021 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCAPD2Q15021 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCAPD2Q15021 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCAPD2Q15021 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms