Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.191e-323■■■■■ 30.4
NOLC1Q14978 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.071e-323■■■■■ 30.4
NOLC1Q14978 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-55■■■■■ 30.4
NOLC1Q14978 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.251e-323■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 225.51■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 315.27■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 311.81□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 36.2□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 30.3
NOLC1Q14978 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.33e-12■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 IDH2-204ENST00000560061 1449 ntTSL 219.28■□□□□ 0.683e-12■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-12■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.364e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 14e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.8■□□□□ 0.924e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.01■□□□□ 0.794e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.594e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.054e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 APOL1-207ENST00000427990 624 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.424e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 EIF3L-213ENST00000482600 1294 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.94□□□□□ -0.824e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.94□□□□□ -0.824e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 GARS-208ENST00000485784 761 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 39.26□□□□□ -0.934e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ALDH1A1-204ENST00000446946 805 ntTSL 58.46□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 30.2
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NOLC1Q14978 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 ALDH1A1-205ENST00000482210 879 ntTSL 26.96□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.77□□□□□ -1.334e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 56.33□□□□□ -1.44e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.41□□□□□ -1.544e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 GARS-202ENST00000444666 619 ntTSL 33.48□□□□□ -1.854e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 GARS-204ENST00000465748 447 ntTSL 23.16□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.974e-16■■■■■ 30.2
NOLC1Q14978 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.372e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-212ENST00000465855 684 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.672e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 210.37□□□□□ -0.752e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.852e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.872e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-215ENST00000484696 611 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 UBAP2L-219ENST00000495676 867 ntTSL 35.97□□□□□ -1.452e-17■■■■■ 30
NOLC1Q14978 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 29.7
NOLC1Q14978 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 29.7
NOLC1Q14978 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 29.7
NOLC1Q14978 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.167e-23■■■■■ 29.6
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NOLC1Q14978 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 MLH1-213ENST00000456676 2230 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-214ENST00000639665 2090 ntTSL 527.67■■■□□ 2.023e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-211ENST00000639398 2127 ntTSL 527.47■■□□□ 1.993e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.83e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-209ENST00000639115 2524 ntTSL 524.72■■□□□ 1.553e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.493e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-217ENST00000640530 2426 ntTSL 523.86■■□□□ 1.413e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.43e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.363e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.343e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.333e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 520.43■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-219ENST00000640967 2569 ntTSL 519.86■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 218.26■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.473e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 03e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 512.07□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 RPL5P1-201ENST00000460716 894 ntBASIC11.26□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 HMBS-210ENST00000539045 845 ntTSL 210.89□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-203ENST00000585680 1792 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 ME2-205ENST00000591925 2092 ntTSL 26.65□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 29.6
NOLC1Q14978 IARS-211ENST00000490438 887 ntTSL 215.22■□□□□ 0.031e-323■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 IARS-203ENST00000395554 1103 ntTSL 514.69□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.121e-10■■■■■ 29.5
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