Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MELKQ14680 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MELKQ14680 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MELKQ14680 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MELKQ14680 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MELKQ14680 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MELKQ14680 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MELKQ14680 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MELKQ14680 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MELKQ14680 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MELKQ14680 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MELKQ14680 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MELKQ14680 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MELKQ14680 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MELKQ14680 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MELKQ14680 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MELKQ14680 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MELKQ14680 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MELKQ14680 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MELKQ14680 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MELKQ14680 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MELKQ14680 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MELKQ14680 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MELKQ14680 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MELKQ14680 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MELKQ14680 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MELKQ14680 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MELKQ14680 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MELKQ14680 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MELKQ14680 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MELKQ14680 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MELKQ14680 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MELKQ14680 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MELKQ14680 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MELKQ14680 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MELKQ14680 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MELKQ14680 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MELKQ14680 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MELKQ14680 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MELKQ14680 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MELKQ14680 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MELKQ14680 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms