Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNIQ14094 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNIQ14094 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNIQ14094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNIQ14094 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNIQ14094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms