Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL9A2Q14055 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL9A2Q14055 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL9A2Q14055 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL9A2Q14055 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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