Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CIRBPQ14011 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CIRBPQ14011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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