Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CDK13Q14004 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CDK13Q14004 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CDK13Q14004 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CDK13Q14004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CDK13Q14004 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.91
CDK13Q14004 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
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