Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FHL3Q13643 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FHL3Q13643 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FHL3Q13643 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FHL3Q13643 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms