Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL3Q13618 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL3Q13618 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CUL3Q13618 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CUL3Q13618 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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