Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX1Q13596 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX1Q13596 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX1Q13596 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX1Q13596 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX1Q13596 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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