Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAE1Q13564 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAE1Q13564 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAE1Q13564 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAE1Q13564 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1660.9 ms