Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF4BQ13523 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF4BQ13523 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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PRPF4BQ13523 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PRPF4BQ13523 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PRPF4BQ13523 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF4BQ13523 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF4BQ13523 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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