Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP3AQ13472 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP3AQ13472 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3AQ13472 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3AQ13472 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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