Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSPB3Q12988 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB3Q12988 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB3Q12988 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB3Q12988 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB3Q12988 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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