Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
GRIN2AQ12879 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
GRIN2AQ12879 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
GRIN2AQ12879 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GRIN2AQ12879 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
GRIN2AQ12879 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GRIN2AQ12879 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms