Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 PCL6YER059W 1263 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 CYT2YKL087C 675 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 RSF1YMR030W 1131 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 CPT1YNL130C 1182 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 RRS1YOR294W 612 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 YBR292CYBR292C 372 nt8.85□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 HMRA1YCR097W 381 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 KRE28YDR532C 1158 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 YLR198CYLR198C 360 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 VPS20YMR077C 666 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 PDC6YGR087C 1692 nt8.84□□□□□ -0.99
SRF1Q12516 CBK1YNL161W 2271 nt8.83□□□□□ -1
SRF1Q12516 RPN14YGL004C 1254 nt8.83□□□□□ -1
SRF1Q12516 LGE1YPL055C 999 nt8.83□□□□□ -1
SRF1Q12516 TGS1YPL157W 948 nt8.83□□□□□ -1
SRF1Q12516 YIL092WYIL092W 1902 nt8.82□□□□□ -1
SRF1Q12516 MER1YNL210W 813 nt8.81□□□□□ -1
SRF1Q12516 HAP5YOR358W 729 nt8.81□□□□□ -1
SRF1Q12516 SUV3YPL029W 2214 nt8.8□□□□□ -1
SRF1Q12516 RRP15YPR143W 753 nt8.8□□□□□ -1
SRF1Q12516 CRC1YOR100C 984 nt8.79□□□□□ -1
SRF1Q12516 TFB4YPR056W 1017 nt8.79□□□□□ -1
SRF1Q12516 PNS1YOR161C 1620 nt8.79□□□□□ -1
SRF1Q12516 PTH2YBL057C 627 nt8.78□□□□□ -1
SRF1Q12516 SUN4YNL066W 1263 nt8.78□□□□□ -1
SRF1Q12516 YAP7YOL028C 738 nt8.78□□□□□ -1
SRF1Q12516 SPR1YOR190W 1338 nt8.78□□□□□ -1
SRF1Q12516 NCA3YJL116C 1014 nt8.77□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 MHO1YJR008W 1017 nt8.77□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 SPC24YMR117C 642 nt8.77□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 CBS1YDL069C 690 nt8.76□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 FES1YBR101C 873 nt8.76□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 ISR1YPR106W 1332 nt8.76□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 MLS1YNL117W 1665 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 YMR265CYMR265C 1386 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 OMA1YKR087C 1038 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 PRE2YPR103W 864 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 CLB5YPR120C 1308 nt8.75□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 PMU1YKL128C 888 nt8.74□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 ERV41YML067C 1059 nt8.74□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 BTS1YPL069C 1008 nt8.74□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 TSR3YOR006C 942 nt8.73□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 MGR3YMR115W 1506 nt8.73□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 REX3YLR107W 1215 nt8.72□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt8.72□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 ZIM17YNL310C 525 nt8.72□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt8.72□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 UME1YPL139C 1383 nt8.72□□□□□ -1.01
SRF1Q12516 RRP40YOL142W 723 nt8.71□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 RHO1YPR165W 630 nt8.71□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 NUP57YGR119C 1626 nt8.71□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 OPI7YDR360W 435 nt8.7□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 CYS3YAL012W 1185 nt8.7□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 CST26YBR042C 1194 nt8.7□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 SLM4YBR077C 489 nt8.7□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 YKR015CYKR015C 1707 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 YHR219WYHR219W 1875 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 TRP4YDR354W 1143 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 YEA4YEL004W 1029 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 MRPL24YMR193W 777 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 YPQ1YOL092W 927 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 ATG29YPL166W 642 nt8.69□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 EDC1YGL222C 528 nt8.68□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 POS5YPL188W 1245 nt8.68□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 ARR1YPR199C 885 nt8.68□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 THI73YLR004C 1572 nt8.68□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 DBR1YKL149C 1218 nt8.67□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 RNA170RNA170 169 nt8.67□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 AAC3YBR085W 924 nt8.67□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 UBS1YBR165W 834 nt8.67□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 HEL2YDR266C 1920 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 CMP2YML057W 1815 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 ITR2YOL103W 1830 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 CYS4YGR155W 1524 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 OCA4YCR095C 1089 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 RMD5YDR255C 1266 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 TRR2YHR106W 1029 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 MPH3YJR160C 1809 nt8.66□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 NPP1YCR026C 2229 nt8.65□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 BTT1YDR252W 450 nt8.65□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 COS6YGR295C 1146 nt8.65□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 RMA1YKL132C 1293 nt8.65□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 IDP3YNL009W 1263 nt8.65□□□□□ -1.02
SRF1Q12516 CKI1YLR133W 1749 nt8.65□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 YHR145CYHR145C 357 nt8.64□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 AIM20YIL158W 615 nt8.64□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 YAT1YAR035W 2064 nt8.64□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 YHR131CYHR131C 2553 nt8.64□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 NDL1YLR254C 570 nt8.63□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 PRS4YBL068W 981 nt8.63□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 NCE102YPR149W 522 nt8.63□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 BIO3YNR058W 1443 nt8.63□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 SHE9YDR393W 1371 nt8.62□□□□□ -1.03
SRF1Q12516 ENT5YDR153C 1236 nt8.62□□□□□ -1.03
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