Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 NUP57YGR119C 1626 nt6.12□□□□□ -1.43
SME1Q12330 CPD1YGR247W 720 nt6.12□□□□□ -1.43
SME1Q12330 CCR4YAL021C 2514 nt6.12□□□□□ -1.43
SME1Q12330 NME1NME1 340 nt6.12□□□□□ -1.43
SME1Q12330 SEC23YPR181C 2307 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 YOR389WYOR389W 1875 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 MEU1YLR017W 1014 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 LIP5YOR196C 1245 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 YPC1YBR183W 951 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 ICL2YPR006C 1728 nt6.11□□□□□ -1.43
SME1Q12330 DAL80YKR034W 810 nt6.1□□□□□ -1.43
SME1Q12330 IPL1YPL209C 1104 nt6.1□□□□□ -1.43
SME1Q12330 AFG3YER017C 2286 nt6.1□□□□□ -1.43
SME1Q12330 KIN1YDR122W 3195 nt6.1□□□□□ -1.43
SME1Q12330 BAP3YDR046C 1815 nt6.09□□□□□ -1.43
SME1Q12330 EFM1YHL039W 1758 nt6.09□□□□□ -1.43
SME1Q12330 ERG24YNL280C 1317 nt6.09□□□□□ -1.43
SME1Q12330 HAL5YJL165C 2568 nt6.09□□□□□ -1.43
SME1Q12330 CDC3YLR314C 1563 nt6.09□□□□□ -1.43
SME1Q12330 ADH7YCR105W 1086 nt6.08□□□□□ -1.44
SME1Q12330 CMK2YOL016C 1344 nt6.07□□□□□ -1.44
SME1Q12330 MHP1YJL042W 4197 nt6.07□□□□□ -1.44
SME1Q12330 EDC3YEL015W 1656 nt6.07□□□□□ -1.44
SME1Q12330 RQC1YDR333C 2172 nt6.06□□□□□ -1.44
SME1Q12330 OPI1YHL020C 1215 nt6.06□□□□□ -1.44
SME1Q12330 LSP1YPL004C 1026 nt6.06□□□□□ -1.44
SME1Q12330 SGV1YPR161C 1974 nt6.06□□□□□ -1.44
SME1Q12330 STP3YLR375W 1032 nt6.05□□□□□ -1.44
SME1Q12330 CRN1YLR429W 1956 nt6.05□□□□□ -1.44
SME1Q12330 EXG2YDR261C 1689 nt6.04□□□□□ -1.44
SME1Q12330 HDA1YNL021W 2121 nt6.04□□□□□ -1.44
SME1Q12330 STE4YOR212W 1272 nt6.04□□□□□ -1.44
SME1Q12330 YPL108WYPL108W 507 nt6.04□□□□□ -1.44
SME1Q12330 STE3YKL178C 1413 nt6.04□□□□□ -1.44
SME1Q12330 MCH2YKL221W 1422 nt6.03□□□□□ -1.44
SME1Q12330 PAU5YFL020C 369 nt6.03□□□□□ -1.44
SME1Q12330 YGR210CYGR210C 1236 nt6.03□□□□□ -1.44
SME1Q12330 BDS1YOL164W 1941 nt6.02□□□□□ -1.45
SME1Q12330 SER2YGR208W 930 nt6.02□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YLR349WYLR349W 507 nt6.02□□□□□ -1.45
SME1Q12330 HTS1YPR033C 1641 nt6.02□□□□□ -1.45
SME1Q12330 ATP2YJR121W 1536 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 GET2YER083C 858 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YER156CYER156C 1017 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 DPH5YLR172C 903 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YMR206WYMR206W 942 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 PGC1YPL206C 966 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YNL295WYNL295W 1575 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 CYB2YML054C 1776 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YEN1YER041W 2280 nt6□□□□□ -1.45
SME1Q12330 SMC5YOL034W 3282 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YPR084WYPR084W 1371 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 NTG1YAL015C 1200 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 SUN4YNL066W 1263 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 INP54YOL065C 1155 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YOR300WYOR300W 309 nt5.99□□□□□ -1.45
SME1Q12330 YHC3YJL059W 1227 nt5.98□□□□□ -1.45
SME1Q12330 RRN10YBL025W 438 nt5.98□□□□□ -1.45
SME1Q12330 ARC35YNR035C 1029 nt5.98□□□□□ -1.45
SME1Q12330 RPS6AYPL090C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
SME1Q12330 RPS6BYBR181C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
SME1Q12330 GPH1YPR160W 2709 nt5.97□□□□□ -1.45
SME1Q12330 MTR3YGR158C 753 nt5.97□□□□□ -1.45
SME1Q12330 SNT309YPR101W 528 nt5.97□□□□□ -1.45
SME1Q12330 TAH11YJR046W 1815 nt5.97□□□□□ -1.45
SME1Q12330 CIR2YOR356W 1896 nt5.96□□□□□ -1.45
SME1Q12330 AGP2YBR132C 1791 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 HEL1YKR017C 1656 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YCR025CYCR025C 411 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 RRP43YCR035C 1185 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 ADH6YMR318C 1083 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 SMK1YPR054W 1167 nt5.96□□□□□ -1.46
SME1Q12330 GSH1YJL101C 2037 nt5.95□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.95□□□□□ -1.46
SME1Q12330 PHO85YPL031C 918 nt5.95□□□□□ -1.46
SME1Q12330 RBS1YDL189W 1374 nt5.94□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YBR232CYBR232C 360 nt5.94□□□□□ -1.46
SME1Q12330 RDR1YOR380W 1641 nt5.94□□□□□ -1.46
SME1Q12330 AMN1YBR158W 1650 nt5.94□□□□□ -1.46
SME1Q12330 TDP1YBR223C 1635 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 CDC7YDL017W 1524 nt5.93□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YOS9YDR057W 1629 nt5.92□□□□□ -1.46
SME1Q12330 PET18YCR020C 648 nt5.92□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YPR127WYPR127W 1038 nt5.92□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YPT10YBR264C 600 nt5.92□□□□□ -1.46
SME1Q12330 CCT3YJL014W 1605 nt5.92□□□□□ -1.46
SME1Q12330 RSP5YER125W 2430 nt5.91□□□□□ -1.46
SME1Q12330 RPL2BYIL018W 765 nt5.91□□□□□ -1.46
SME1Q12330 YMR074CYMR074C 438 nt5.91□□□□□ -1.46
SME1Q12330 ERG12YMR208W 1332 nt5.91□□□□□ -1.46
SME1Q12330 ACO1YLR304C 2337 nt5.91□□□□□ -1.46
SME1Q12330 SKY1YMR216C 2229 nt5.9□□□□□ -1.46
SME1Q12330 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.9□□□□□ -1.46
SME1Q12330 ARP3YJR065C 1350 nt5.9□□□□□ -1.47
SME1Q12330 VTS1YOR359W 1572 nt5.89□□□□□ -1.47
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