Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 MET30YIL046W 1923 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 HRB1YNL004W 1365 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 LAT1YNL071W 1449 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 SPS1YDR523C 1473 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 CDC3YLR314C 1563 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 CBK1YNL161W 2271 nt8.42□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 PPZ2YDR436W 2133 nt8.41□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 CKI1YLR133W 1749 nt8.41□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 DSC3YOR223W 879 nt8.41□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 YOX1YML027W 1158 nt8.4□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 YPC1YBR183W 951 nt8.4□□□□□ -1.06
CLF1Q12309 FRT1YOR324C 1809 nt8.39□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 PRY2YKR013W 990 nt8.39□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 YNL190WYNL190W 615 nt8.39□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 BEM1YBR200W 1656 nt8.39□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 URA1YKL216W 945 nt8.38□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 PTH2YBL057C 627 nt8.38□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 SMC5YOL034W 3282 nt8.37□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 TRR2YHR106W 1029 nt8.37□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 PET10YKR046C 852 nt8.37□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 MLS1YNL117W 1665 nt8.37□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 SKP1YDR328C 585 nt8.36□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 LAS17YOR181W 1902 nt8.36□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 DIA4YHR011W 1341 nt8.35□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 PIL1YGR086C 1020 nt8.35□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 ADE16YLR028C 1776 nt8.35□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 DAL80YKR034W 810 nt8.34□□□□□ -1.07
CLF1Q12309 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.33□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 CKB1YGL019W 837 nt8.33□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 PAM17YKR065C 594 nt8.33□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 PRS4YBL068W 981 nt8.33□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 YPL067CYPL067C 597 nt8.33□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 AVL9YLR114C 2295 nt8.32□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 UME1YPL139C 1383 nt8.32□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 AIM46YHR199C 933 nt8.31□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 YML122CYML122C 381 nt8.31□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 YPQ1YOL092W 927 nt8.31□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 YHR131CYHR131C 2553 nt8.31□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 MGM101YJR144W 810 nt8.3□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 ERV25YML012W 636 nt8.3□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 ADH6YMR318C 1083 nt8.3□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 CST26YBR042C 1194 nt8.3□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 HSV2YGR223C 1347 nt8.29□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 PEX28YHR150W 1740 nt8.29□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 OPI1YHL020C 1215 nt8.29□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 CYS3YAL012W 1185 nt8.28□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 CMK2YOL016C 1344 nt8.28□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 TPO1YLL028W 1761 nt8.27□□□□□ -1.08
CLF1Q12309 PFS2YNL317W 1398 nt8.27□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 CAR2YLR438W 1275 nt8.27□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 DML1YMR211W 1428 nt8.27□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 HEL1YKR017C 1656 nt8.27□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 YDR215CYDR215C 414 nt8.26□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 RCF2YNR018W 675 nt8.25□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 AFG2YLR397C 2343 nt8.25□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 YER152CYER152C 1332 nt8.25□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 LEO1YOR123C 1395 nt8.24□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 YJL213WYJL213W 996 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 CCW12YLR110C 402 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 MDH2YOL126C 1134 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 MBF1YOR298C-A 456 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 ARO7YPR060C 771 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 CTF3YLR381W 2202 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 TUB1YML085C 1344 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 BDS1YOL164W 1941 nt8.23□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 NFS1YCL017C 1494 nt8.22□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 YPQ2YDR352W 954 nt8.22□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 MCP1YOR228C 909 nt8.22□□□□□ -1.09
CLF1Q12309 GGC1YDL198C 903 nt8.21□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 YAH1YPL252C 519 nt8.21□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 RSC9YML127W 1746 nt8.2□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 SNF7YLR025W 723 nt8.2□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 AAD14YNL331C 1131 nt8.2□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 PMT7YDR307W 1989 nt8.2□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 YCR061WYCR061W 1896 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 YIL108WYIL108W 2091 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 VPS65YLR322W 315 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 LGE1YPL055C 999 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 SPE3YPR069C 882 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 ERG24YNL280C 1317 nt8.19□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 YJL144WYJL144W 315 nt8.18□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 RTC2YBR147W 891 nt8.18□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 CIT2YCR005C 1383 nt8.18□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 YPL041CYPL041C 624 nt8.17□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 MET13YGL125W 1803 nt8.15□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 PMT1YDL095W 2454 nt8.15□□□□□ -1.1
CLF1Q12309 MSB3YNL293W 1902 nt8.15□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 UBP13YBL067C 2244 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 MPE1YKL059C 1326 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 YDR327WYDR327W 327 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 PET117YER058W 324 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 AIM34YMR003W 597 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 ZIM17YNL310C 525 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 DAL7YIR031C 1665 nt8.14□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 YEN1YER041W 2280 nt8.13□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 YLR162WYLR162W 357 nt8.13□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 snR30snR30 606 nt8.13□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 CIR2YOR356W 1896 nt8.13□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 PLB3YOL011W 2061 nt8.12□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 GET4YOR164C 939 nt8.11□□□□□ -1.11
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