Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 CDC13YDL220C 2775 nt7.42□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 DST1YGL043W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 MNN9YPL050C 1188 nt7.42□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 MRP1YDR347W 966 nt7.41□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 CAR2YLR438W 1275 nt7.41□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 PAU21YOR394W 495 nt7.41□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 PAU22YPL282C 495 nt7.41□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 MET8YBR213W 825 nt7.41□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 YDR215CYDR215C 414 nt7.4□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 LOT6YLR011W 576 nt7.4□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 ARG7YMR062C 1326 nt7.4□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 GDH1YOR375C 1365 nt7.4□□□□□ -1.22
RUP1Q12242 MSB3YNL293W 1902 nt7.39□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 JHD1YER051W 1479 nt7.39□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 ELP4YPL101W 1371 nt7.39□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 TAD2YJL035C 753 nt7.38□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 TDH1YJL052W 999 nt7.38□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YGL260WYGL260W 231 nt7.37□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YOR343CYOR343C 327 nt7.37□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 SRF1YDL133W 1314 nt7.36□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YCR041WYCR041W 333 nt7.36□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 CPR2YHR057C 618 nt7.36□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 FCY2YER056C 1602 nt7.36□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YDR327WYDR327W 327 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 PAC10YGR078C 600 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YIL168WYIL168W 384 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 YKL147CYKL147C 618 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 PRY2YKR013W 990 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 BUD20YLR074C 501 nt7.35□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 PPZ2YDR436W 2133 nt7.34□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 ERV25YML012W 636 nt7.34□□□□□ -1.23
RUP1Q12242 GCD11YER025W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 TRR1YDR353W 960 nt7.33□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 SNF4YGL115W 969 nt7.33□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YOR012WYOR012W 414 nt7.33□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YAH1YPL252C 519 nt7.33□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 HHY1YEL059W 309 nt7.32□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 AIM2YAL049C 741 nt7.32□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 CCR4YAL021C 2514 nt7.32□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 ADE1YAR015W 921 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YLR112WYLR112W 420 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YOR389WYOR389W 1875 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 SSC1YJR045C 1965 nt7.31□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 SEC23YPR181C 2307 nt7.3□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 NUP53YMR153W 1428 nt7.3□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YPC1YBR183W 951 nt7.3□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 NUP57YGR119C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 NUP84YDL116W 2181 nt7.29□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 LIP5YOR196C 1245 nt7.29□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 ICL2YPR006C 1728 nt7.29□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 KIN1YDR122W 3195 nt7.28□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 DAL80YKR034W 810 nt7.28□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 MEU1YLR017W 1014 nt7.28□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 EFM1YHL039W 1758 nt7.28□□□□□ -1.24
RUP1Q12242 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.27□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 CDC3YLR314C 1563 nt7.27□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 PSP2YML017W 1782 nt7.27□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 AFG3YER017C 2286 nt7.27□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 ERG24YNL280C 1317 nt7.27□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 SNU66YOR308C 1764 nt7.26□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 BAP3YDR046C 1815 nt7.26□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 EDC3YEL015W 1656 nt7.25□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 TOS1YBR162C 1368 nt7.24□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 RQC1YDR333C 2172 nt7.24□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 EXG2YDR261C 1689 nt7.23□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 OPI1YHL020C 1215 nt7.23□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 PAB1YER165W 1734 nt7.23□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 SPR1YOR190W 1338 nt7.23□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 HAC1YFL031W 717 nt7.22□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 FUS3YBL016W 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 CPT1YNL130C 1182 nt7.22□□□□□ -1.25
RUP1Q12242 ADE2YOR128C 1716 nt7.21□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 PNS1YOR161C 1620 nt7.2□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 STE3YKL178C 1413 nt7.2□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 MHP1YJL042W 4197 nt7.2□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 MCH2YKL221W 1422 nt7.19□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 YDR476CYDR476C 675 nt7.18□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 EDC2YER035W 438 nt7.18□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 BDS1YOL164W 1941 nt7.18□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 PET494YNR045W 1470 nt7.17□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 CYB2YML054C 1776 nt7.16□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 MAM3YOL060C 2121 nt7.16□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 YNL295WYNL295W 1575 nt7.16□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 GET2YER083C 858 nt7.15□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 NAS6YGR232W 687 nt7.15□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 NTG1YAL015C 1200 nt7.15□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 INP54YOL065C 1155 nt7.15□□□□□ -1.26
RUP1Q12242 RRN10YBL025W 438 nt7.14□□□□□ -1.27
RUP1Q12242 SUN4YNL066W 1263 nt7.14□□□□□ -1.27
RUP1Q12242 ARC35YNR035C 1029 nt7.14□□□□□ -1.27
RUP1Q12242 AGP2YBR132C 1791 nt7.13□□□□□ -1.27
RUP1Q12242 RRP43YCR035C 1185 nt7.13□□□□□ -1.27
RUP1Q12242 MTR3YGR158C 753 nt7.13□□□□□ -1.27
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