Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YEN1YER041W 2280 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 CKI1YLR133W 1749 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 HAC1YFL031W 717 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 STS1YIR011C 960 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YJL043WYJL043W 774 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YOR268CYOR268C 399 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 RTC2YBR147W 891 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YPC1YBR183W 951 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 UBP13YBL067C 2244 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 RUP1YOR138C 2016 nt6.43□□□□□ -1.38
USB1Q12208 DAL7YIR031C 1665 nt6.42□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YPT10YBR264C 600 nt6.42□□□□□ -1.38
USB1Q12208 PDC5YLR134W 1692 nt6.42□□□□□ -1.38
USB1Q12208 TOS1YBR162C 1368 nt6.42□□□□□ -1.38
USB1Q12208 MSB3YNL293W 1902 nt6.41□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YDR215CYDR215C 414 nt6.4□□□□□ -1.38
USB1Q12208 DAL80YKR034W 810 nt6.4□□□□□ -1.38
USB1Q12208 ERV2YPR037C 591 nt6.4□□□□□ -1.38
USB1Q12208 CIR2YOR356W 1896 nt6.4□□□□□ -1.39
USB1Q12208 PSA1YDL055C 1086 nt6.39□□□□□ -1.39
USB1Q12208 OPI1YHL020C 1215 nt6.38□□□□□ -1.39
USB1Q12208 ADH6YMR318C 1083 nt6.38□□□□□ -1.39
USB1Q12208 DSC3YOR223W 879 nt6.38□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YAH1YPL252C 519 nt6.38□□□□□ -1.39
USB1Q12208 HXT9YJL219W 1704 nt6.38□□□□□ -1.39
USB1Q12208 CBK1YNL161W 2271 nt6.37□□□□□ -1.39
USB1Q12208 PET494YNR045W 1470 nt6.37□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YDR327WYDR327W 327 nt6.37□□□□□ -1.39
USB1Q12208 ERV25YML012W 636 nt6.37□□□□□ -1.39
USB1Q12208 NMD5YJR132W 3147 nt6.37□□□□□ -1.39
USB1Q12208 ERG24YNL280C 1317 nt6.36□□□□□ -1.39
USB1Q12208 TPI1YDR050C 747 nt6.36□□□□□ -1.39
USB1Q12208 PPZ2YDR436W 2133 nt6.36□□□□□ -1.39
USB1Q12208 GNA1YFL017C 480 nt6.36□□□□□ -1.39
USB1Q12208 AIM34YMR003W 597 nt6.36□□□□□ -1.39
USB1Q12208 OSM1YJR051W 1506 nt6.35□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YER152CYER152C 1332 nt6.35□□□□□ -1.39
USB1Q12208 VPS65YLR322W 315 nt6.35□□□□□ -1.39
USB1Q12208 ASN2YGR124W 1719 nt6.35□□□□□ -1.39
USB1Q12208 SPS1YDR523C 1473 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 MFG1YDL233W 1377 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 DCR2YLR361C 1737 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 HXT13YEL069C 1695 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 MGM101YJR144W 810 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YLR030WYLR030W 792 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YOS9YDR057W 1629 nt6.34□□□□□ -1.39
USB1Q12208 YJR142WYJR142W 1029 nt6.33□□□□□ -1.4
USB1Q12208 MAL31YBR298C 1845 nt6.33□□□□□ -1.4
USB1Q12208 ITR1YDR497C 1755 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 GTS1YGL181W 1191 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 SNA3YJL151C 402 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 SPE4YLR146C 903 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 MSI1YBR195C 1269 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 BDS1YOL164W 1941 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 YBL113CYBL113C 2379 nt6.32□□□□□ -1.4
USB1Q12208 HRB1YNL004W 1365 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 PRC1YMR297W 1599 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 TCB1YOR086C 3561 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 YGL081WYGL081W 963 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 PRY2YKR013W 990 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 MAS2YHR024C 1449 nt6.31□□□□□ -1.4
USB1Q12208 CDC13YDL220C 2775 nt6.3□□□□□ -1.4
USB1Q12208 YOR041CYOR041C 432 nt6.3□□□□□ -1.4
USB1Q12208 ADE17YMR120C 1779 nt6.3□□□□□ -1.4
USB1Q12208 HNM1YGL077C 1692 nt6.3□□□□□ -1.4
USB1Q12208 SKP1YDR328C 585 nt6.29□□□□□ -1.4
USB1Q12208 PIL1YGR086C 1020 nt6.29□□□□□ -1.4
USB1Q12208 KAE1YKR038C 1161 nt6.29□□□□□ -1.4
USB1Q12208 TOP3YLR234W 1971 nt6.29□□□□□ -1.4
USB1Q12208 YJL213WYJL213W 996 nt6.28□□□□□ -1.4
USB1Q12208 YLR358CYLR358C 564 nt6.28□□□□□ -1.4
USB1Q12208 PRP2YNR011C 2631 nt6.28□□□□□ -1.4
USB1Q12208 NMA2YGR010W 1188 nt6.27□□□□□ -1.41
USB1Q12208 PAM17YKR065C 594 nt6.27□□□□□ -1.41
USB1Q12208 MSS51YLR203C 1311 nt6.26□□□□□ -1.41
USB1Q12208 HAL5YJL165C 2568 nt6.26□□□□□ -1.41
USB1Q12208 TOS2YGR221C 1869 nt6.26□□□□□ -1.41
USB1Q12208 CDC23YHR166C 1881 nt6.26□□□□□ -1.41
USB1Q12208 AFG3YER017C 2286 nt6.26□□□□□ -1.41
USB1Q12208 PRE5YMR314W 705 nt6.25□□□□□ -1.41
USB1Q12208 CDC3YLR314C 1563 nt6.25□□□□□ -1.41
USB1Q12208 YNL040WYNL040W 1371 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 NCA3YJL116C 1014 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 YJR154WYJR154W 1041 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 YKL147CYKL147C 618 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 CCW12YLR110C 402 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 ATP10YLR393W 840 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 HSM3YBR272C 1443 nt6.24□□□□□ -1.41
USB1Q12208 CAN1YEL063C 1773 nt6.23□□□□□ -1.41
USB1Q12208 CHA1YCL064C 1083 nt6.23□□□□□ -1.41
USB1Q12208 YGL260WYGL260W 231 nt6.23□□□□□ -1.41
USB1Q12208 DPH5YLR172C 903 nt6.23□□□□□ -1.41
USB1Q12208 MLS1YNL117W 1665 nt6.23□□□□□ -1.41
USB1Q12208 DOC1YGL240W 753 nt6.22□□□□□ -1.41
USB1Q12208 PET117YER058W 324 nt6.21□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YIP4YGL198W 708 nt6.21□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YML122CYML122C 381 nt6.21□□□□□ -1.42
USB1Q12208 CIT2YCR005C 1383 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 YPQ2YDR352W 954 nt6.2□□□□□ -1.42
USB1Q12208 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.2□□□□□ -1.42
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