Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal1Q0VBP7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Shisal1Q0VBP7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms