Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt80Q0VBK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt80Q0VBK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt80Q0VBK2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt80Q0VBK2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms