Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAGPQ0VAQ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAGPQ0VAQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMAGPQ0VAQ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms