Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASGEF1BQ0VAM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RASGEF1BQ0VAM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RASGEF1BQ0VAM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms