Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntnap5aQ0V8T9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5aQ0V8T9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cntnap5aQ0V8T9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5aQ0V8T9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms