Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcnt1Q09324 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcnt1Q09324 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcnt1Q09324 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gcnt1Q09324 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gcnt1Q09324 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcnt1Q09324 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gcnt1Q09324 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcnt1Q09324 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gcnt1Q09324 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms