Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 HAL5YJL165C 2568 nt7.54□□□□□ -1.2
CLP1Q08685 ADE16YLR028C 1776 nt7.54□□□□□ -1.2
CLP1Q08685 ATP23YNR020C 813 nt7.53□□□□□ -1.2
CLP1Q08685 ERV2YPR037C 591 nt7.53□□□□□ -1.2
CLP1Q08685 YGL081WYGL081W 963 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 PIH1YHR034C 1035 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 INM1YHR046C 888 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 YJR142WYJR142W 1029 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 ATP10YLR393W 840 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 DIA4YHR011W 1341 nt7.52□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 DIP5YPL265W 1827 nt7.51□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 YNL140CYNL140C 570 nt7.51□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 OSM1YJR051W 1506 nt7.51□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 DOC1YGL240W 753 nt7.5□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.5□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 ITR1YDR497C 1755 nt7.5□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 YER152CYER152C 1332 nt7.5□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 CBK1YNL161W 2271 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 SGE1YPR198W 1632 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 MSI1YBR195C 1269 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 GPA1YHR005C 1419 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 TIF3YPR163C 1311 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 FCP1YMR277W 2199 nt7.49□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 PSA1YDL055C 1086 nt7.48□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 ARO3YDR035W 1113 nt7.48□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 GLY1YEL046C 1164 nt7.48□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 INP54YOL065C 1155 nt7.48□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 RRP43YCR035C 1185 nt7.47□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 ALG7YBR243C 1347 nt7.47□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 STE3YKL178C 1413 nt7.46□□□□□ -1.21
CLP1Q08685 NMA2YGR010W 1188 nt7.46□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 CPR2YHR057C 618 nt7.46□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 TRR2YHR106W 1029 nt7.46□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 PTH2YBL057C 627 nt7.46□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 DAL4YIR028W 1908 nt7.46□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 AIM46YHR199C 933 nt7.45□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 RGT2YDL138W 2292 nt7.45□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 PFS2YNL317W 1398 nt7.45□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 YPT10YBR264C 600 nt7.44□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 CDC3YLR314C 1563 nt7.44□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 YNL295WYNL295W 1575 nt7.43□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 HSV2YGR223C 1347 nt7.43□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 DST1YGL043W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 PRS4YBL068W 981 nt7.42□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 MDH2YOL126C 1134 nt7.42□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 HAM1YJR069C 594 nt7.41□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 YOR041CYOR041C 432 nt7.41□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 HRB1YNL004W 1365 nt7.41□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 ACO1YLR304C 2337 nt7.41□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 EDC3YEL015W 1656 nt7.41□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 GET2YER083C 858 nt7.4□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 PRY2YKR013W 990 nt7.4□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 AOS1YPR180W 1044 nt7.4□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 KTR4YBR199W 1395 nt7.4□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 MTC6YHR151C 1581 nt7.4□□□□□ -1.22
CLP1Q08685 YLL058WYLL058W 1728 nt7.4□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 PRC1YMR297W 1599 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 SPS1YDR523C 1473 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YHR033WYHR033W 1272 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 PAM17YKR065C 594 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 DSC3YOR223W 879 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 PMT7YDR307W 1989 nt7.39□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 WSC4YHL028W 1818 nt7.38□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 MRN1YPL184C 1839 nt7.38□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YMR253CYMR253C 1245 nt7.38□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 CST26YBR042C 1194 nt7.38□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YPL067CYPL067C 597 nt7.38□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 VTS1YOR359W 1572 nt7.37□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 UME1YPL139C 1383 nt7.37□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 AIM3YBR108W 2844 nt7.37□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YPQ1YOL092W 927 nt7.37□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 PPZ2YDR436W 2133 nt7.36□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 CYS3YAL012W 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 AAD14YNL331C 1131 nt7.36□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 MCP1YOR228C 909 nt7.36□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 SKP1YDR328C 585 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 PIL1YGR086C 1020 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YJL144WYJL144W 315 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YML122CYML122C 381 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 LGE1YPL055C 999 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 SPE3YPR069C 882 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.35□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 ERR3YMR323W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 ERR1YOR393W 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 ERR2YPL281C 1314 nt7.34□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 YPC1YBR183W 951 nt7.34□□□□□ -1.23
CLP1Q08685 MLS1YNL117W 1665 nt7.33□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 DML1YMR211W 1428 nt7.33□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 CDA1YLR307W 906 nt7.32□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 YOR111WYOR111W 699 nt7.32□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 AGP2YBR132C 1791 nt7.32□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 HGH1YGR187C 1185 nt7.31□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 ICL2YPR006C 1728 nt7.31□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 AQR1YNL065W 1761 nt7.31□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 VBA5YKR105C 1749 nt7.3□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 MET13YGL125W 1803 nt7.3□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 QCR6YFR033C 444 nt7.3□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 ELP6YMR312W 822 nt7.3□□□□□ -1.24
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