Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfdp1Q08639 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfdp1Q08639 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfdp1Q08639 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tfdp1Q08639 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfdp1Q08639 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms