Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 SNF7YLR025W 723 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 HDA1YNL021W 2121 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 YOR041CYOR041C 432 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 SPS1YDR523C 1473 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 BEM1YBR200W 1656 nt7.53□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 PPZ2YDR436W 2133 nt7.52□□□□□ -1.2
CUE5Q08412 TPI1YDR050C 747 nt7.52□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.52□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YJL043WYJL043W 774 nt7.52□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 HAL5YJL165C 2568 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 MAL31YBR298C 1845 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 NCA3YJL116C 1014 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 ERV2YPR037C 591 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YPT10YBR264C 600 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 ITR1YDR497C 1755 nt7.51□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 OPI1YHL020C 1215 nt7.5□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 HRA1HRA1 564 nt7.5□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YAH1YPL252C 519 nt7.5□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 RTC2YBR147W 891 nt7.5□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YKR023WYKR023W 1593 nt7.49□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 CKI1YLR133W 1749 nt7.49□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 TCB1YOR086C 3561 nt7.49□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 DAL7YIR031C 1665 nt7.48□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 STS1YIR011C 960 nt7.48□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 BDS1YOL164W 1941 nt7.48□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 PMA2YPL036W 2844 nt7.47□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 OSM1YJR051W 1506 nt7.47□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 TOP3YLR234W 1971 nt7.46□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 FRT1YOR324C 1809 nt7.46□□□□□ -1.21
CUE5Q08412 YJR142WYJR142W 1029 nt7.46□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 DPH5YLR172C 903 nt7.46□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 SGV1YPR161C 1974 nt7.46□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YDR327WYDR327W 327 nt7.45□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YDR476CYDR476C 675 nt7.45□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 DSC3YOR223W 879 nt7.45□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 SKP1YDR328C 585 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 GTS1YGL181W 1191 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 PRY2YKR013W 990 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YOR343CYOR343C 327 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 SMC5YOL034W 3282 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 CDC23YHR166C 1881 nt7.44□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YEN1YER041W 2280 nt7.43□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 CRN1YLR429W 1956 nt7.43□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 BUD20YLR074C 501 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 ATP10YLR393W 840 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 FUS3YBL016W 1062 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 BAP3YDR046C 1815 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 ERG24YNL280C 1317 nt7.42□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 AFG3YER017C 2286 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 BIM1YER016W 1035 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YOR300WYOR300W 309 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 MSS51YLR203C 1311 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 PET494YNR045W 1470 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 CIR2YOR356W 1896 nt7.41□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YKR018CYKR018C 2178 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YGL260WYGL260W 231 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 NMA2YGR010W 1188 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 YKL147CYKL147C 618 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 ERR3YMR323W 1314 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 ERR1YOR393W 1314 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 ERR2YPL281C 1314 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 HRB1YNL004W 1365 nt7.4□□□□□ -1.22
CUE5Q08412 RMD8YFR048W 1989 nt7.4□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 NDE1YMR145C 1683 nt7.39□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 KAE1YKR038C 1161 nt7.39□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 YMR253CYMR253C 1245 nt7.39□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 LIP5YOR196C 1245 nt7.39□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 GGC1YDL198C 903 nt7.38□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 YGL081WYGL081W 963 nt7.38□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 FLC2YAL053W 2352 nt7.37□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 CAN1YEL063C 1773 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 MSI1YBR195C 1269 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 PRB1YEL060C 1908 nt7.36□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 RPL12BYDR418W 498 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 YER137CYER137C 447 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 CCW12YLR110C 402 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 YLR358CYLR358C 564 nt7.35□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 CDC3YLR314C 1563 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 CCR4YAL021C 2514 nt7.34□□□□□ -1.23
CUE5Q08412 CTF3YLR381W 2202 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 SEC24YIL109C 2781 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 DOC1YGL240W 753 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 PIL1YGR086C 1020 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 RDR1YOR380W 1641 nt7.33□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 CDC7YDL017W 1524 nt7.32□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 POB3YML069W 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 TOD6YBL054W 1578 nt7.31□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 FCY2YER056C 1602 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 NUP57YGR119C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 EXG2YDR261C 1689 nt7.3□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 MAS2YHR024C 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 YHC3YJL059W 1227 nt7.29□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 YJL213WYJL213W 996 nt7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.5 ms