Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHRNDQ07001 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNDQ07001 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHRNDQ07001 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHRNDQ07001 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHRNDQ07001 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHRNDQ07001 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms