Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Caprin2Q05A80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caprin2Q05A80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caprin2Q05A80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Caprin2Q05A80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Caprin2Q05A80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms