Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gch1Q05915 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gch1Q05915 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gch1Q05915 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gch1Q05915 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms