Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprgQ05909 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprgQ05909 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprgQ05909 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprgQ05909 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprgQ05909 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprgQ05909 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprgQ05909 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms