Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox13Q04891 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sox13Q04891 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sox13Q04891 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox13Q04891 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms