Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Sox12Q04890 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sox12Q04890 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sox12Q04890 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sox12Q04890 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sox12Q04890 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sox12Q04890 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms