Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EMX2Q04743 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMX2Q04743 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMX2Q04743 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms