Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pfdn6Q03958 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pfdn6Q03958 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pfdn6Q03958 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pfdn6Q03958 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms