Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC4Q03721 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC4Q03721 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNC4Q03721 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNC4Q03721 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms