Protein–RNA interactions for Protein: Q03164

KMT2A, Histone-lysine N-methyltransferase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 3,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT2AQ03164 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KMT2AQ03164 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KMT2AQ03164 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
KMT2AQ03164 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KMT2AQ03164 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms