Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddr1Q03146 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddr1Q03146 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddr1Q03146 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddr1Q03146 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddr1Q03146 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms