Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Nucb1Q02819 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nucb1Q02819 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nucb1Q02819 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nucb1Q02819 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Nucb1Q02819 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nucb1Q02819 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms