Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT1Q02742 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCNT1Q02742 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCNT1Q02742 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCNT1Q02742 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCNT1Q02742 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms