Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JupQ02257 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JupQ02257 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JupQ02257 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JupQ02257 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JupQ02257 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JupQ02257 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JupQ02257 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JupQ02257 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JupQ02257 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JupQ02257 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JupQ02257 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JupQ02257 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JupQ02257 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JupQ02257 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JupQ02257 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JupQ02257 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JupQ02257 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JupQ02257 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JupQ02257 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JupQ02257 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JupQ02257 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JupQ02257 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JupQ02257 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JupQ02257 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JupQ02257 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JupQ02257 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
JupQ02257 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JupQ02257 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JupQ02257 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JupQ02257 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JupQ02257 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JupQ02257 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JupQ02257 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JupQ02257 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JupQ02257 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JupQ02257 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
JupQ02257 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
JupQ02257 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
JupQ02257 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
JupQ02257 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JupQ02257 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JupQ02257 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
JupQ02257 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JupQ02257 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JupQ02257 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JupQ02257 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JupQ02257 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JupQ02257 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JupQ02257 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JupQ02257 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JupQ02257 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JupQ02257 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JupQ02257 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JupQ02257 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JupQ02257 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
JupQ02257 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms