Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMP22Q01453 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMP22Q01453 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMP22Q01453 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMP22Q01453 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PMP22Q01453 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms