Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
CLTCQ00610 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CLTCQ00610 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CLTCQ00610 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLTCQ00610 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
CLTCQ00610 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLTCQ00610 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms