Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCCQ00597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCCQ00597 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FANCCQ00597 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FANCCQ00597 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCCQ00597 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCCQ00597 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCCQ00597 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCCQ00597 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCCQ00597 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCCQ00597 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FANCCQ00597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCCQ00597 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCCQ00597 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCCQ00597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCCQ00597 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCCQ00597 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FANCCQ00597 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCCQ00597 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCCQ00597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCCQ00597 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCCQ00597 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCCQ00597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCCQ00597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCCQ00597 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms