Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFAMQ00059 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFAMQ00059 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFAMQ00059 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFAMQ00059 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms