Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thumpd3P97770 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thumpd3P97770 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thumpd3P97770 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thumpd3P97770 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms