Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx2P97474 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pitx2P97474 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pitx2P97474 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pitx2P97474 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms